马刺自从99年夺冠以后，后场就解散了。这几年后场和内线脱节几个档次，挡拆那是根本打不出来，后来帕克来了，出色的挡拆重现江湖，吉诺比利来了，解决了关键时刻的刺刀作用，可惜的是，吉诺比利身体总是不能保持健康，导致…马刺无法持续夺冠
01年，马刺二号得分手德里克安德森打小牛的时候被霍二叔废了，打湖人的时候科比的防守者变成了安东尼奥丹尼尔斯。前两场比赛，马刺上半场高强度的防守成功的限制了奥尼尔，但是也对阵容深度严重不足的马刺造成了很大的体力消耗，丹尼尔斯中场接受记者采访的时候已经喘气喘的一句完成的话都说不出来了，明眼人也能看出来马刺的防守到了强弩之末。
下半场随着马刺强度的下降，湖人的进攻点开始爆发，马刺外线被科比一个人满场溜，费舍尔系列赛投出了百分之75的三分命中率。第二场邓肯砍下40分15板，还是不敌湖人，于是乎有了三四场消极比赛的嫌疑。但是一个夏天后，展现在人们面前的是一个更强的邓肯，各项数据都是生涯新高，于是迎来了第二年的湖马大战。
当时的马刺其实属于最近20年的巅峰期，因为邓肯处于巅峰期。当时马刺还是双塔战术，虽然无法绝对限制奥尼尔，但是这个内线组合也是十分强大（其中99-00赛季，常规赛末邓肯半月板撕裂，赛季报销），邓肯完全是变态级别的（前8年包揽7次最佳一阵6次防守一阵，一次二阵2次防守二阵）。
2000-2001赛季，作为卫冕冠军的湖人队，常规赛打出56胜26负的战绩，位居西部第二。而马刺队，在波波诸葛维奇的带领下，常规赛拿到58胜24负，领跑全联盟。但可惜的是，即便在常规赛打出如此出色的战绩，在西部决赛上，马刺被湖人横扫。科比表现亮眼四场比赛场均轰下33.3分7篮板7助攻，奥尼尔同样表现出色砍下27分13篮板。而反观马刺这边，邓肯场均得到23分12.3篮板，生涯末年的大卫罗宾逊只有14.3分10.8篮板。
那个时候马刺虽有双塔，但海军上将已现老态，过了职业巅峰期。邓肯在99-00赛季半月板撕裂缺席季后赛，马刺在季后赛首轮就被太阳队给淘汰了。整体上看，那个时候马刺的阵容还不具备夺冠的绝对实力，还处于广积粮的阶段，后来随着帕克、鲍文、杰克逊、吉诺比利的到来，马刺才真正到了缓称王的时期。湖人三连冠时期的阵容中并不止奥尼尔一个无解，还有一个就是“ok组合”的K——科比·布莱恩特。奥尼尔和科比两人联手场均可以轰下50-70分，而马刺只有邓肯独木难支。
这样的阵容，在赢弱的东部，不躺进东决，那对得起老板吗？一个老板拿那么多钱养这些人，如果打还进东决，那岂不是要哭晕在厕所里了！这么豪华的阵容，在赢弱的东部，不说给杜兰特或者哈登带，就是给龟少带，也能躺进东决。詹姆斯带着这么豪华的阵容，对上连个像样的明星都没有的凯尔特人，甚至都是一些拿着两三佰万的新秀们，而且是打得那么艰难。
马刺的转机从2002年的夏天开始，马努·吉诺比利加盟，GDP组合初见雏形。同时斯蒂芬·杰克逊和布鲁斯·鲍文开始在球队里扮演重要角色。与此同时，获得三连冠的湖人开始马放南山刀枪入库，除了科比，以至于其他人都失去了对冠军的渴望。
所以，自从2002-03赛季。再经历了两个月的慢热后，马刺开始发力，每年二月份的一次长途客场之旅，他们取得了客场8连胜战绩，最后以60胜22负领跑全联盟，邓肯继乔丹之后，联盟第一位蝉联MVP的球员，波波维奇首次当选最佳教练。2003年季后赛，马刺用四个4比2先后击败太阳、湖人、小牛和篮网，获得球队第二个总冠军，大卫·罗宾逊也在2003年总决赛后光荣隐退。
